江蘇中輝-實(shí)驗(yàn)小鼠核酸樣品單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記檢測的能力驗(yàn)證結(jié)果評價(jià)
2023.02.08摘要：通過實(shí)施全國范圍的小鼠DNA核酸樣品單核苷酸多態(tài)性 （single nucleotide polymorphism，SNP） 標(biāo)記檢測能力驗(yàn)證計(jì)劃，檢測各實(shí)驗(yàn)室小鼠遺傳質(zhì)控SNP檢測技術(shù)水平，推動核酸樣品及SNP檢測技術(shù)的應(yīng)用。
目的 通過實(shí)施全國范圍的小鼠DNA核酸樣品單核苷酸多態(tài)性 （single nucleotide polymorphism，SNP） 標(biāo)記檢測能力驗(yàn)證計(jì)劃，檢測各實(shí)驗(yàn)室小鼠遺傳質(zhì)控SNP檢測技術(shù)水平，推動核酸樣品及SNP檢測技術(shù)的應(yīng)用。
方法 按照中國食品藥品檢定研究院2022年組織實(shí)施的“NIFDC-PT-365實(shí)驗(yàn)小鼠DNA樣品SNP標(biāo)記檢測能力驗(yàn) 證計(jì)劃”方案要求，各參加實(shí)驗(yàn)室均獲得 BALB/c 和 C57BL/6 來源的隨機(jī)編號 DNA 盲樣 2 份、作業(yè)指導(dǎo)書、 rs3023177和rs3023382 SNP位點(diǎn)引物2對。參與者在規(guī)定時(shí)限內(nèi)提交報(bào)告和原始記錄，突變位點(diǎn)擴(kuò)增測序結(jié)果與方 案預(yù)設(shè)一致時(shí)判為滿意，否則判為不滿意。同時(shí)，對各實(shí)驗(yàn)室的PCR擴(kuò)增體系及測序比對方式進(jìn)行比較，分析可能 影響小鼠核酸標(biāo)準(zhǔn)樣品SNP檢測結(jié)果的相關(guān)因素。
結(jié)果 10個(gè)參加實(shí)驗(yàn)室在2個(gè)SNP位點(diǎn)的盲樣測序分型上皆與 預(yù)設(shè)一致，均獲得滿意結(jié)果。不同擴(kuò)增體積 （20 µL、25 µL、30 µL）、不同Taq酶體系 （單組分與PCR MIX），以 及不同的測序公司、測序方向、比對軟件均未影響結(jié)果準(zhǔn)確性。
結(jié)論 各參加實(shí)驗(yàn)室在小鼠DNA核酸樣品SNP標(biāo) 記檢測項(xiàng)目上均具有較強(qiáng)的檢測能力。SNP檢測技術(shù)在小鼠遺傳質(zhì)量評價(jià)中簡便易行，值得推廣。
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